Steking (hemija)
U hemiji, pi staking (π–π steking) je privlačna, nekovalentna interakcija između aromatičnih prstenova. Te interakcije su važne u vezivanju nukleobaza unutar DNK i RNK molekula, proteinskom savijanju, šablonom usmerenoj sintezi, nauci o materijalima, i molekulskom prepoznavanju. Uprkos intenzivnog eksperimentalnog i teoretskog izučavanja ove forme vezivanja, ne postoji jedinstveni opis faktora koji doprinose interakcijama pi stekinga.
Evidencija za pi staking
[уреди | уреди извор]Benzenski dimer je prototipni sistem za izučavanje pi stekinga. Eksperimentalno određena jačina veze je 8–12 kJ/mol (2–3 kcal/mol) u gasnoj fazi sa raztojanjem od 4.96 Å između centera mase. Ovo rastojanje je izvan van der Valsovog radijusa. Mala energija vezivanja otežava eksperimentalno izučavanje benzenskog dimera. Ovaj dimer je stabilan samo na nikim temperaturama i sklon je formiranju klastera.[1]
Drugi dokazi za postojanje pi stekinga proizilaze iz kristalografkih struktura. Normalne i paralelne konfiguracije se mogu primetiti u kristalnim strukturama mnogih jednostavnih aromatičnih jedinjenja.[1] Slične geometrijske strukture su primetne u kristalogravskim snimcima proteina pri visokoj rezoluciji. Analiza aromatičnih aminokiselina fenilalanina, tirozina, histidina, i triptofana indiciraju da dimeri tih bočnih lanaca imaju mnoštvo mogućih stabilizujućih interakcija na rastojanjima većim od prosečnih van der Valsovih radijusa.[2]
Reference
[уреди | уреди извор]- ^ а б Sinnokrot, MO; Valeev, EF; Sherrill, CD (2002). „Estimates of the ab initio limit for pi-pi interactions: The benzene dimer”. J. Am. Chem. Soc. 124 (36): 10887—10893. PMID 12207544. doi:10.1021/ja025896h.
- ^ McGaughey, GB; Gagné, M; Rappé, AK (1998). „Pi-Stacking interactions. Alive and well in proteins”. J. Biol. Chem. 273 (25): 15458—15463. PMID 9624131. doi:10.1074/jbc.273.25.15458.
Vidi još
[уреди | уреди извор]Spoljašnje veze
[уреди | уреди извор]- The physical basis of nucleic acid base stacking in water. Архивирано на сајту Wayback Machine (30. јун 2019)